Odbor diagnostických laboratórií

ODBOR DIAGNOSTICKÝCH LABORATÓRIÍ

Odbor diagnostických laboratórií tvoria referáty karanténnej diagnostiky v Bratislave, Rovinke, Vígľaši a v Košiciach.  Na základe čl. 100 Nariadenia (EÚ) 2017/625 o úradných kontrolách a iných úradných činnostiach vykonávaných na zabezpečenie uplatňovania potravinového a krmivového práva a pravidiel pre zdravie zvierat a dobré životné podmienky zvierat, pre zdravie rastlín a pre prípravky na ochranu rastlín boli jednotlivé referáty poverené MPRV SR národnými referenčnými laboratóriami a úradnými laboratóriami:

  • Referát karanténnej diagnostiky Bratislava, pracovisko Bratislava (ďalej len „BA-RKDB, pracovisko Bratislava“) - NRL pre geneticky modifikované organizmy a škodce rastlín so zameraním na baktérie, vírusy, viroidy a fytoplazmy, huby a riasovky, hmyz a roztoče - vykonáva analýzy pre OKVZ, OOaS, OOR a OOS.

  • Referát karanténnej diagnostiky Bratislava, pracovisko Rovinka (ďalej len „RO-RKDB, pracovisko Rovinka“) - NRL pre škodce so zameraním na vírusy, háďatká a hmyz a roztoče – vykonáva diagnostiku pre OOR, OOS a OOaS, a mikrobiologické analýzy pre OKVZ a OPH.

  • Referát karanténnej diagnostiky Košice (ďalej len „KE-RKDK“) – NRL pre škodce so zameraním na baktérie, huby a riasovky, háďatká a hmyz a roztoče – vykonáva diagnostiku pre OOR, OOS, OOaS a ORP.

  • Referát karanténnej diagnostiky Vígľaš (ďalej len „VI-RKDV“) – NRL pre škodce so zameraním na háďatká a huby – vykonáva diagnostiku pre OOR, OOS a OOaS.

 

 

Referát karanténnej diagnostiky Bratislava (BA-RKDB a RO-RKDB) patrí pod Odbor diagnostických laboratórií ÚKSÚP. Pracovisko sídli v Bratislave a časť činností vykonáva aj v Rovinke. 

 

Referát karanténnej diagnostiky Bratislava – pracovisko Bratislava (BA-RKDB)

V súlade s kompetenciami ÚKSÚP a platnou legislatívou SR a ES sú výkony laboratórií  zamerané na stanovenie prítomnosti, identifikáciu a kvantifikáciu GMO v rastlinných komoditách, krmivách, bioproduktoch a potravinových vstupoch, na monitoring a kontrolu úrovne koexistencie GMO, ďalej na genetický popis, rozlíšenie a identifikáciu odrôd rastlín, analýzy odrodovej pravosti a čistoty osív, sadív a merkantilu a na detekciu a identifikáciu karanténnych rastlinných patogénov a regulovaných škodlivých organizmov rastlín, ktoré môžu ohrozovať poľnohospodárstvo, lesníctvo a životné prostredie. 

 

 

Hlavné činnosti:

  • Detekcia a identifikácia vírusov, baktérií, húb, háďatiek a živočíšnych škodcov rastlín,

  • Kontrola GMO, kontrola pestovania GMO a environmentálneho monitoringu GMO,

  • Genetický popis, rozlíšenie a identifikácia odrôd rastlín, analýza odrodovej pravosti a čistoty osív, sadív a merkantilu. 

 

Používané diagnostické metódy:

Referát využíva široké spektrum moderných laboratórnych metód, napríklad:

  • End-point PCR a Real-time PCR na molekulárnu identifikáciu patogénov, detekciu, identifikáciu a kvantifikáciu GMO

  • Sekvenačné analýzy na identifikáciu rastlinných patogénov

  • Proteínový fingerprinting v PAGE a SDS-PAGE podľa ISTA, UPOV a CPVO

 

Činnosti BA-RKDB, pracoviska Bratislava vyplývajúce z úloh a kompetencií NRL na základe platnej európskej legislatívy: 

  • Zabezpečovanie systému kvality podľa ISO/IEC 17025:2017 pre oblasť skúšania odrôd, osív, sadív, merkantilu, rastlinného tovaru, bioproduktov, krmív a potravinárskych vstupov, GMO, zdravotného stavu rastlín a rastlinných patogénov, 

  • Spolupráca s referenčným laboratóriom spoločenstva EURL GMFF v oblasti svojej kompetencie a poskytovanie informácií národným orgánom, garantovanie nových laboratórnych metód a metodických postupov,

  • Poskytovanie vedeckej a technickej pomoci národným orgánom pri zavádzaní koordinovaných plánov kontrol (MANCAP), 

  • Účasť na odborných rokovaniach na národnej a medzinárodnej úrovni,

  • Spolupráca s referenčnými laboratóriami spoločenstva EURL pre škodce rastlín so  zameraním na baktérie, EURL pre škodce rastlín so zameraním na vírusy, viroidy a fytoplazmy, EURL pre škodce rastlín so zameraním na huby a riasovky a EURL pre škodce rastlín so zameraním na hmyz a roztoče.

 

Referát karanténnej diagnostiky Bratislava – pracovisko Rovinka (RO-RKDB) je špecializované diagnostické laboratórium ÚKSÚP zamerané na diagnostiku karanténnych a ostatných škodlivých organizmov rastlín. 

Pracovisko v Rovinke je zároveň centrálnym diagnostickým pracoviskom, na ktoré sa zasielajú vzorky z celého Slovenska pri podozrení na výskyt viacerých karanténnych škodcov a chorôb rastlín. Túto adresu uvádzajú aj národné pohotovostné plány ÚKSÚP pre množstvo regulovaných škodlivých organizmov.

Hlavné činnosti:

  • Diagnostika karanténnych škodcov Európskej únie a ďalších regulovaných škodlivých organizmov, 

  • Identifikácia vírusov, baktérií, fytoplaziem, húb, háďatiek, hmyzu a ďalších živočíchov napádajúcich rastliny a rastlinné produkty, 

  • Detekcia, stanovenie a identifikáciu patogénnych a podmienečne patogénnych mikroorganizmov v krmivách a hnojivách,

  • Stanovenie mikrobiologických parametrov v rastlinných biostimulantoch a ostatných hnojivách vrátane počtu deklarovaných mikroorganizmov,

  • Stanovenie počtu a identifikáciu mikroorganizmov používaných ako probiotické doplnkové látky v krmivách,

  • Zisťovanie prítomnosti patogénnych baktérií vo vode spôsobujúcich ochorenia rastlín,

 

Používané diagnostické metódy: 

  • Molekulárno-biologické metódy (LAMP PCR)

  • Imunochemické metódy (ELISA) 

  • Mikrobiologické metódy

  • Mikroskopické a stereomikroskopické metódy

  • Izolácie patogénov na živných médiách 

 

Činnosti BA-RKDB, pracoviska Rovinka vyplývajúce z úloh a kompetencií NRL na základe platnej európskej legislatívy:

  • Potvrdzovanie výskytu karanténnych organizmov zistených pri úradných kontrolách, 

  • Analýzy vzoriek odobratých pri národných monitorovacích programoch a pri dovoze rastlín a rastlinných produktov, 

  • Spolupráca s rastlinolekárskou inšpekciou pri monitorovaní výskytu škodlivých organizmov, 

  • Vypracovávanie metodík, odborných stanovísk a účasť na medzinárodnej spolupráci (EPPO, EURL, EFSA), 

  • Spolupráca s referenčnými laboratóriami spoločenstva EURL pre škodce rastlín so  zameraním na baktérie, EURL pre škodce rastlín so zameraním na vírusy, viroidy a fytoplazmy, EURL pre škodce rastlín so zameraním na huby a riasovky a EURL pre škodce rastlín so zameraním na hmyz a roztoče,

  • Vykonávanie akreditovaných laboratórnych skúšok podľa normy ISO/IEC 17025.

 

 

Referát karanténnej diagnostiky Vígľaš (VI-RKDV) je špecializované diagnostické laboratórium ÚKSÚP zamerané na diagnostiku karanténnych a ostatných škodlivých organizmov rastlín. 

 

Hlavné činnosti:

Diagnostika škodlivých organizmov

  • identifikácia húb, háďatiek a ďalších škodcov rastlín, 

  • vyšetrenie rastlín, rastlinných produktov a pôdy, 

  • kontrola domácich aj dovážaných rastlín na prítomnosť karanténnych organizmov, 

  • laboratórna diagnostika podľa legislatívy EÚ a štandardov EPPO. 

 

Monitoring významných škodcov

  • Rakovinovec zemiakový (Synchytrium endobioticum),

  • Cystotvorné háďatká zemiakové (Globodera rostochiensis a Globodera pallida), 

  • Voľnežijúce háďatká (Meloidogyne fallax, M. chitwoodi, M. enterolobii,

M. graminicola ).

 

Štátne skúšky rezistencie

  • Testy rezistencie odrôd zemiakov voči háďatkám, 

  • Testy rezistencie voči rakovinovcovi zemiakovému, 

  • Biologické skúšky potrebné pri registrácii a hodnotení odrôd.

 

Používané diagnostické metódy:

  • Stereomikroskopia

  • Svetelná mikroskopia

  • Flotačné a vyplavovacie metódy na izoláciu háďatiek 

Iinkubácia rastlinného materiálu

  • Morfologická identifikácia patogénov

  • Digitálne snímkovanie a analýza obrazu

 

 

Činnosti VI-RKDV, pracoviska Vígľaš vyplývajúce z úloh a kompetencií NRL na základe platnej európskej legislatívy:

•          Spolupráca s referenčnými laboratóriami spoločenstva EURL pre škodce rastlín so  zameraním na baktérie, EURL pre škodce rastlín so zameraním na vírusy, viroidy a fytoplazmy, EURL pre škodce rastlín so zameraním na huby a riasovky a EURL pre škodce rastlín so zameraním na hmyz a roztoče,

•          Spolupráca s rastlinolekárskymi inšpektormi ÚKSÚP, 

•          Spolupráca s výskumnými pracoviskami.

 

Referát karanténnej diagnostiky Košice (KE-RKDK) je špecializované diagnostické laboratórium ÚKSÚP zamerané na diagnostiku karanténnych a ostatných škodlivých organizmov rastlín. 

 

Hlavné činnosti:

Diagnostika škodlivých organizmov

  • Identifikácia baktérií, húb, vírusov, fytoplaziem, hmyzu a ďalších škodcov rastlín,

  • Vyšetrenie rastlín, osív, sadív, dreva, pôdy a rastlinných produktov, 

  • Potvrdzovanie výskytu karanténnych organizmov pri úradných kontrolách, 

  • Diagnostika podľa legislatívy EÚ a medzinárodných štandardov EPPO. 

 

Referát zabezpečuje laboratórne vyšetrenia vzoriek od rastlinolekárskych inšpektorov ÚKSÚP:

  • V zmysle Zákona č. 405/2011 Z.z. a nariadenia EP a R (EÚ) 2017/625 ,

  • Dovoz rastlín a rastlinných produktov na ochranu územia SR pred šírením a zavliekaním škodlivých organizmov,

  •  Monitoring   škodlivých organizmov na území Slovenska, 

  • Podozrenie na výskyt nebezpečných chorôb alebo škodcov. 

 

Používané diagnostické metódy:

  • Svetelná  stereomikroskopia a mikroskopia s digitálnym snímkovaním a následnou analýzou obrazu

  • Molekulárne metódy (PCR, Real-time PCR, LAMP PCR) 

  • Sérologické metódy (ELISA, prietoková cytometria)

  • Imunofluorescenčná mikroskopia

  • Kultivačné metódy 

  • Morfologická identifikácia 

  • Extrakčné metódy - izolácia patogénov zo vzoriek

 

Činnosti KE-RKDK, pracoviska Košice vyplývajúce z úloh a kompetencií NRL na základe platnej európskej legislatívy:

•          Potvrdzovanie výskytu karanténnych organizmov zistených pri úradných kontrolách, 

•          Analýzy vzoriek odobratých pri národných monitorovacích programoch a pri dovoze rastlín a rastlinných produktov, 

•          Spolupráca s rastlinolekárskou inšpekciou pri monitorovaní výskytu škodlivých organizmov, 

•          Vypracovávanie metodík, odborných stanovísk a účasť na medzinárodnej spolupráci (EPPO, EURL, EFSA), 

•          Spolupráca s referenčnými laboratóriami spoločenstva EURL pre škodce rastlín so  zameraním na baktérie, EURL pre škodce rastlín so zameraním na vírusy, viroidy a fytoplazmy, EURL pre škodce rastlín so zameraním na huby a riasovky a EURL pre škodce rastlín so zameraním na hmyz a roztoče,

•          Vykonávanie akreditovaných laboratórnych skúšok podľa normy ISO/IEC 17025.